Da die Symptomatik der Borreliose nahezu unerschöpflich ist, besteht die Gefahr der Verwechslung mit einer anderen Erkrankung. So kann sich zum Beispiel hinter einer diagnostizierten multiplen Sklerose, einer rheumatoiden Arthritis, einem Reizdarm oder einer Fibromyalgie ebenfalls eine Borreliose verstecken. Daher ist bei jeder Erkrankung im Autoimmunbereich ebenfalls an eine Parasitierung des Erkrankten als Ursache der Erkrankung zu denken und entsprechend zu behandeln.
